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遗传图谱

遗传图谱介绍

  • 遗传图谱(Genetic map)又称遗传连锁图谱(Genetic linkage map),是分子标记在染色体上的排列顺序与相对距离的线形图。基于重测序技术构建高密度遗传图谱正逐渐成为研究者青睐的技术,它的优势在于可较快地开发大量的分子标记,可以获得遗传图谱,克服了基于低通量分子标记隐密度低而不能提供准确的QTLs 数目和座位信息的缺点。

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应用方向

  • 基因组 scaffolds 的排序,改善基因组拼接质量
  • QTL 定位

分析内容

分析内容
下机数据统计
数据质控
高质量数据获取
参考基因组整理
序列比对
序列比对结果概述
SNP检测
SNP统计
SNP注释
SNP分型及筛选
遗传连锁图谱构建
单体型来源评估
重组热点评估
遗传距离与物理距离相关性分析
QTL定位

案例解析

欧洲梨树高密度分子遗传图谱构建和营养生长相关QTL定位

梨在发芽期遇上低温,容易导致芽休眠,从而对梨的生产影响很大。所以研究控制梨树遇到低温芽休眠的基因有重要的意义。本研究通过高通量测序构建了欧洲梨的高密度分子遗传图谱,并成功定位了影响梨树叶芽休眠的关键基因。可以应用于梨树的标记辅助选择育种。

图片8
QTL定位分析

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